Chỉ một ngày sau khi tung ra cập nhật Java 2012 -03 dành cho người dùng Mac bị nhiễm Flashback thì Apple ngày hôm nay đã tung ra công cụ để đối phó triệt để với con botnet này. Phiên bản v1.0 của công cụ có tên đầy đủ Flashback malware removal tool sẽ quét toàn bộ hệ thống và xoá bỏ botnet Flashback nếu nó hiện hữu trên máy tính của bạn. Phần mềm này chỉ có dung lượng 356KB và có thể được tải về tại đây. Tuy nhiên, để sử dụng phần mềm này, máy người dùng phải chạy OS X Lion và chưa được cài Java.